Ce projet serait sous la direction de : M. Gildas MERCERON et Mme Emilie BERLIOZ
Unité de recherche : PALEVOPRIM
Ecole doctorale : Rosalind Franklin – énergie, environnement, bio santé
Intitulé du sujet :
Cervidés, écologies et territoires : comprendre le présent pour mieux gérer l’avenir. Une approche multi-indicateurs dans les socio-écosystèmes anthropisés
Deer, Ecologies, and Territories: Understanding the Present to Better Manage the Future. A Multi-Indicator Approach in Anthropized Socio-Ecosystems
Mots clés : Changements climatiques ; Cervus elaphus ; Capreolus capreolus ; Nouvelle-Aquitaine ; paléobiologie de la conservation ; éco-indicateurs transdisciplinaires ; anthropisation ; socio-écosystèmes ; gestion des grands ongulés sauvages
Début de thèse : à partir du 01/10/2026
Résumé :
Le cerf élaphe (Cervus elaphus) et le chevreuil (Capreolus capreolus), parmi les ongulés sauvages les plus abondants en France, jouent un rôle écologique majeur mais génèrent aussi des conflits croissants avec les activités humaines (dégâts agricoles, collisions, maladies). Pour mieux comprendre les facteurs environnementaux et anthropiques influençant leurs dynamiques actuelles, cette thèse adopte une approche multi-indicateurs en étudiant plusieurs populations en Nouvelle-Aquitaine. En combinant des collections ostéo-dentaires du laboratoire Palévoprim et des échantillons fournis par des partenaires locaux (ANCGG, FRCNA), le projet mobilise des éco-indicateurs complémentaires (isotopes stables de l’émail, méso-usure dentaire, morphométrie mandibulaire, textures de micro-usures dentaires) et une analyse spatiale SIG pour explorer leurs écologies et identifier l’impact des caractéristiques structurantes des territoires.
Les résultats fourniront un diagnostic écologique inédit, directement mobilisable par les acteurs du territoire pour ajuster les stratégies de gestion et réduire les conflits. Le/La la doctorant(e) participera à des congrès internationaux, publiera dans des revues de rang A et contribuera à la diffusion des connaissances vers les acteurs locaux et le grand public.
Red deer (Cervus elaphus) and roe deer (Capreolus capreolus), among the most abundant wild ungulates in France, play a major ecological role but also generate increasing conflicts with human activities (agricultural damage, collisions, disease transmission). To better understand the environmental and anthropogenic factors shaping their current dynamics, this thesis adopts a multi-indicator approach, studying several populations in Nouvelle-Aquitaine. By combining osteodental collections from the Palévoprim laboratory and samples provided by local partners (ANCGG, FRCNA), the project uses complementary eco-indicators (stable isotopes from dental enamel, dental mesowear, mandibular morphometry, dental microwear textures) and GIS spatial analysis to explore their ecologies and identify the impact of structuring territorial features.
The results will provide an unprecedented ecological diagnostic, directly usable by local stakeholders to adjust management strategies and reduce conflicts. The PhD candidate will participate in international conferences, publish in international scientific journals, and contribute to knowledge dissemination among local stakeholders and the general public.
Contexte et problématique :
Le cerf élaphe (Cervus elaphus) et le chevreuil (Capreolus capreolus) sont, avec le sanglier, les espèces d’ongulés sauvages les plus abondantes en France métropolitaine, et jouent un rôle écologique majeur dans les socio-écosystèmes. Architectes des paysages mais aussi sources de contraintes pour les activités humaines (dégâts agricoles, collisions, transmission de maladies), leurs populations sont en forte augmentation depuis 50 ans. Face à cette situation, il est essentiel de comprendre quels sont les facteurs environnementaux et anthropiques contraignant aujourd’hui leur écologie, et comment leurs trajectoires écologiques pourraient évoluer à court et moyen termes.
Red deer (Cervus elaphus) and roe deer (Capreolus capreolus), along with wild boar, are the most abundant wild ungulate species in mainland France. They play a major ecological role in socio-ecosystems but also pose significant challenges for human activities (e.g., agricultural damage, vehicle collisions, disease transmission). Their populations have increased sharply over the past 50 years. In this context, it is essential to understand the environmental and anthropogenic factors currently shaping their ecology and to anticipate how their ecological trajectories may evolve in the short and medium term.
Description du sujet :
Le/la doctorant(e) étudiera plusieurs populations actuelles de cerfs élaphes et chevreuils. Pour cela, il/elle s’appuiera sur les riches collections de matériel ostéo-dentaire accessibles au laboratoire Palévoprim pour ces deux espèces, ainsi que sur le matériel fourni par l’Association Nationale des Chasseurs de Grand Gibier (ANCGG) et la Fédération Régionale des Chasseurs de Nouvelle-Aquitaine (FRCNA), toutes deux partenaires du projet. Le/la doctorant(e) mettra en œuvre les quatre éco-indicateurs présentés ci-dessous sur les mêmes individus. En parallèle, il/elle extraira les caractéristiques spatiales des territoires occupés par ces populations via une approche de cartographie SIG. En intégrant les données écologiques aux contextes paysagers et anthropiques, le/la doctorant(e) sera en mesure d’identifier des caractéristiques spatiales structurant les écologies observées.
Les résultats constitueront un diagnostic écologique inédit pour les populations de ces deux cervidés en Nouvelle-Aquitaine, directement mobilisable par les acteurs du territoire (Office Français de la Biodiversité, fédérations de chasse, gestionnaires d’espaces naturels, collectivités), et pourront conduire à un ajustement des stratégies de gestion actuellement mises en œuvre, afin notamment de réduire les conflits d’usage avec les humains.
Grâce à cette expertise, le/la doctorant(e) disposera d’un profil très attractif, tant pour la recherche fondamentale que pour les métiers appliqués de la gestion de la faune sauvage, lui ouvrant un large spectre d’opportunités professionnelles. Ce projet doctoral s’inscrit dans la dynamique émergente de la Paléobiologie de la Conservation, en dialogue avec l’autre thèse portant sur les trajectoires sur le temps long (Eémien).
The PhD candidate will study several modern populations of red deer and roe deer. He/She will rely on the rich osteodental collections available at the Palévoprim laboratory for these two species, as well as on material provided by the Association Nationale des Chasseurs de Grand Gibier (ANCGG) and the Fédération Régionale des Chasseurs de Nouvelle-Aquitaine (FRCNA), both partners in the project. The candidate will apply four eco-indicators (detailed below) to the same individuals. In parallel, He/She will extract spatial characteristics of the territories occupied by these populations using a GIS mapping approach. By integrating ecological data with landscape and anthropogenic contexts, the candidate will identify spatial features that structure the observed ecologies.
The results will provide an unprecedented ecological assessment of these two deer species in Nouvelle-Aquitaine, directly usable by local stakeholders (Office Français de la Biodiversité, hunting federations, natural space managers, local authorities). This assessment may lead to adjustments in current management strategies to reduce human-wildlife conflicts.
Through this expertise, the PhD candidate will develop a highly attractive profile for both fundamental research and applied careers in wildlife management, opening a wide range of rofessional opportunities. This doctoral project aligns with the emerging field of Conservation Paleobiology, in dialogue with the complementary thesis focusing on long-term trajectories (Eemian period).
Méthodologie et mise en œuvre :
Le/la doctorant(e) combinera quatre éco-indicateurs complémentaires sous la supervision d’Emilie Berlioz (laboratoire Palévoprim, Université de Poitiers), à savoir les isotopes stables de l’émail dentaire, la méso-usure dentaire, la morphométrie-géométrique de la mandibule et les textures de micro-usure dentaire, pour lesquelles le laboratoire Palévoprim est un référent à l’échelle internationale. Il/elle bénéficiera à ce titre des infrastructures analytiques de la plateforme d’imagerie du laboratoire. En parallèle, le/la doctorant(e) développera une expertise en analyse spatiale multi-échelle (SIG) sous la supervision de Nicolas Bech (Laboratoire EBI, Université de Poitiers), qui permettra d’intégrer les données biologiques aux contextes paysagers et anthropiques, et de modéliser les mécanismes spatiaux à l’origine des écologies observées.
Des réunions régulières avec les encadrants seront organisées (toutes les semaines, puis adaptées en fonction des besoins et de l’autonomie du/de la candidat(e)). Au cours de sa thèse, le/la candidat(e) sera amené à partir en mission sur le terrain afin de récupérer le matériel biologique et de rencontrer les acteurs locaux. Il/elle sera amené(e) à gérer de grandes quantités de données. Il/elle conduira des analyses statistiques poussées avec le logiciel R.
Le/La doctorant(e) sera basé(e) au laboratoire Palévoprim, et inscrit(e) à l’école doctorale Rosalind Franklin et bénéficiera de formations.
Il/Elle participera à un congrès scientifique international par an au minimum, développant ainsi une visibilité scientifique essentielle pour la poursuite d’une carrière académique. Il/elle publiera des articles dans des journaux scientifiques de rang A, en anglais (1 minimum). Enfin, il est attendu que le/la doctorant(e) s’investisse dans la vie du laboratoire (séminaires internes, journal clubs) et intervienne régulièrement dans les activités de diffusion des connaissances auprès grand public (fête de la science, journées du patrimoine, Journée internationale des femmes et des filles de science le cas échéant, …).
The PhD candidate will combine four complementary eco-indicators under the supervision of Emilie Berlioz (Palévoprim laboratory, University of Poitiers): stable isotopes from dental enamel, dental mesowear, geometric morphometry of the mandible, dental microwear textures. The Palévoprim laboratory is an international reference for this last method, and the candidate will benefit from its analytical infrastructure. Additionally, the candidate will develop expertise in multi-scale spatial analysis (GIS), supervised by Nicolas Bech (EBI Laboratory, University of Poitiers). This will enable the integration of biological data with landscape and anthropogenic contexts, as well as the modeling of spatial mechanisms underlying observed ecologies.
Regular meetings with supervisors will be organized (weekly at first, then adjusted based on needs and autonomy). During the thesis, the candidate will conduct field missions to collect biological material and meet local stakeholders. They will manage large datasets and perform advanced statistical analyses using R.
The PhD candidate will be will be based at the Palévoprim lab and will be part of the Rosalind Franklin Doctoral School and will benefit from training programs. He/She will participate in at least one international scientific conference per year, developing essential scientific visibility for an academic career. He/She will publish at least one article in an international scientific journal (in English). Finally, the candidate is expected to engage in laboratory life (internal seminars, journal clubs) and regularly contribute to public outreach activities (Science Festival, Heritage Days, International Day of Women and Girls in Science, etc.).
Profil recherché :
Le/la candidat(e) recherché(e) possède une formation initiale d’écologue ou de paléontologue.
Compétences souhaitées :
– Maîtrise de l’anglais lu, parlé, écrit (la maîtrise du français sera un plus, mais n’est pas obligatoire).
– Connaissances solides en écologie.
– Aisance en statistiques avec le logiciel R. (un intérêt pour le Machine learning est un atout)
– Une expérience préalable dans l’un des éco-indicateurs cités ci-dessus serait un plus, mais n’est pas obligatoire.
– Une expérience préalable en SIG sera un plus
– Capacités organisationnelles
– Aptitude à travailler en équipe comme en autonomie
– Compétence de vulgarisation
The candidate holds a degree in ecology or paleontology.
Desired Skills:
– Proficiency in English (reading, writing, speaking); French is a plus but not mandatory.
– Strong background in ecology.
– Experience with statistical analysis using R; interest in machine learning is an asset.
– Prior experience with one or more of the eco-indicators mentioned above is desirable but not required.
– Prior experience in GIS is a plus.
– Organizational skills.
– Ability to work both independently and as part of a team.
– Science communication skills.
Contact pour plus d’informations et pour candidater jusqu’au 15/05/26 :
Emilie BERLIOZ : emilie.berlioz@cnrs.fr